重点实验室“污染环境微生物生态”研究团队前期与美国田纳西大学合作,在葡萄渣堆肥样品中发现并富集了一株可以利用包括一氯乙烯在内的多种氯代烯烃进行生长的新型脱卤单胞菌,通过宏基因组、宏蛋白质组学技术鉴定出其一氯乙烯还原性脱卤酶基因,并将该菌株命名为‘candidatus dehalogenimonas etheniformans’ gp。之前的研究中仅发现脱卤拟球菌属的部分菌株能够以呼吸代谢的形式脱氯降解这一人类致癌物,gp菌株的发现拓展了修复有机氯污染环境的微生物资源。



本研究在生理及进化特征上进一步完善了对脱卤单胞菌属成员的认识,为卤代烃污染场地中的生物修复提供了理论支持和菌株资源。gp菌株已被中国普通微生物菌种保藏管理中心(cgmcc)和日本理化研究所生物资源中心(jcm)保藏。在此特别鸣谢重点实验室“微生物资源与生态”团队为本研究中磷脂脂肪酸提取与分析工作提供的支持。相关科研发表成果如下。
1. yang y, higgins sa, yan j, simsir b, chourey k, iyer r, hettich rl, baldwin b, ogles dm, loffler fe. 2017. grape pomace compost harbors organohalide-respiring dehalogenimonas species with novel reductive dehalogenase genes. isme j11: 2767-2780..
2. 杨毅, 张耀之, 李秀颖, 曾祥峰, 宋玉芳, 严俊. 2019. (dehalococcodia class)在有机卤化物生物地球化学循环中的作用. 环境科学学报, 39: 3207-3214.
3. yang y, sanford r, yan j, chen g, capiro nl, li x, loffler fe. 2020a. respiring dehalococcoidia in carbon cycling. msystems, 5: e00757-19. https://doi.org/10.1128/msystems.00757-19.
4. yang y, zhang y, capiro nl, yan j. 2020c. geographically distributed dehalococcoidia. front microbiol, 11: 546063. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.546063.
5. yang y, yan j, li x, lv y, cui y, kara-murdoch f, chen g, loffler fe. 2020b. genome sequence of "candidatus dehalogenimonas etheniformans" strain gp, a vinyl chloride-respiring anaerobe. microbiol resour announc, 9: e01212-20.
6. 吕燕, 李秀颖, 王晶晶, 金慧娟, 崔逸儒, 杨毅, 严俊. 2021. 一株脱卤单胞菌属有机卤呼吸细菌的分离纯化与基础特征. 微生物学报, 6: 1016-1029.
7. 崔逸儒, 杨毅, 严俊, 李秀颖. 2021. 脱卤单胞菌属在厌氧降解有机氯化物及污染场地修复应用中的研究进展. 生物工程学报, 37: 3565-3577.
chen g, murdoch fk, xie y, murdoch rw, cui y, yang y, yan j, key ta, loffler fe. 2022. dehalogenation of chlorinated ethenes to ethene by a novel isolate, "candidatus dehalogenimonas etheniformans". appl environ microbiol, 88: e00443-22. https://doi.org/10.1128/aem.00443-22.
9. cui y, li x, yan j, lv y, jin h, wang j, chen g, kara-murdoch f, yang y, loffler fe. 2023. sp. nov., a formate-oxidizing, organohalide-respiring bacterium isolated from grape pomace. int j syst evol microbiol, 73. https://doi.org/10.1099/ijsem.0.005881.